Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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