Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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