Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SGCGQ13326 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SGCGQ13326 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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