Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHAF1BQ13112 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHAF1BQ13112 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CHAF1BQ13112 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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