Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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