Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
MKRN3Q13064 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
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