Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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