Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LMAN2Q12907 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms