Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CENPFP49454 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CENPFP49454 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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