Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TMPOP42166 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TMPOP42166 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TMPOP42166 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TMPOP42166 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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