Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TMIGD3P0DMS9 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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