Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA3O43365 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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