Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
C4orf47A7E2U8 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms