Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.9 ms