Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms