Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
C10orf55Q5SWW7 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms