Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms