Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FXNQ16595 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FXNQ16595 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FXNQ16595 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms