Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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