Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms