Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
MTMR3Q13615 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms