Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
DUSP4Q13115 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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