Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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