Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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BPTFQ12830 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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BPTFQ12830 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
BPTFQ12830 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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