Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms