Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms