Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 FAM161B-201ENST00000286544 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 PHBP7-201ENST00000415677 814 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 C4orf51-201ENST00000438731 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC018697.1-202ENST00000582650 592 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL356095.2-201ENST00000624025 457 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 CRX-207ENST00000613299 4193 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 LINC00943-203ENST00000535544 2815 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 FZD6-201ENST00000358755 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC044810.2-202ENST00000527847 2503 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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CNKSR2Q8WXI2 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 ABI2-211ENST00000422511 2718 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 RNF138-201ENST00000257190 2071 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 AC124804.1-202ENST00000583712 4315 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CNKSR2Q8WXI2 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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