Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RAB6CQ53S08 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RAB6CQ53S08 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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