Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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