Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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