Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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