Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NME3Q13232 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NME3Q13232 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms