Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CENPFP49454 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CENPFP49454 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CENPFP49454 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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CENPFP49454 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CENPFP49454 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CENPFP49454 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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