Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKHD1P08F94 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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PKHD1P08F94 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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