Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
LRRIQ1Q96JM4 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms