Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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