Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SS18Q15532 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SS18Q15532 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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SS18Q15532 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SS18Q15532 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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