Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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