Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HTR4Q13639 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HTR4Q13639 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms