Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CUL4AQ13619 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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CUL4AQ13619 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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