Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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