Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXO1Q12778 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXO1Q12778 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXO1Q12778 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXO1Q12778 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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FOXO1Q12778 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXO1Q12778 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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