Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TTPAP49638 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms