Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
ACADSBP45954 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms