Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL4A5P29400 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL4A5P29400 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A5P29400 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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