Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 LINC01353-201ENST00000412772 775 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL356095.2-201ENST00000624025 457 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FXYD1-201ENST00000351325 592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 FUNDC2P4-201ENST00000441207 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXB1P14653 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms