Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXA2O43364 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms