Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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