Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C4orf47A7E2U8 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms