Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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